Estandarización y validación de la prueba de pcr anidada para el diagnóstico de especies del género xyleborus (coleoptera: curculionidae: scolytinae)

Autores/as

  • María Elena Sosa-Castillo Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo
  • Joel Lara Reyna Colegio de Postgraduados, Campus Campeche
  • Laura Delia Ortega Arenas Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo
  • Alfonsina Judith Hernández Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo

DOI:

https://doi.org/10.21829/azm.2017.3311008

Palabras clave:

Escarabajos ambrosiales, identificación molecular, diagnóstico, gen CO1

Resumen

En este estudio se estandarizó y validó la técnica de PCR anidada para la detección rápida, sensible y confiable de especies del género Xyleborus mediante el uso de los primers externos CI-J-2183 y TL2-N-3014 e internos J2210 y N2739, que amplifican una banda de 500 pb de la región del gen mitocondrial Citocromo Oxidasa subunidad 1(CO1). Asimismo, se realizó la extracción de ADN de 26 ejemplares de Xyleborus con el kit Qiagen DNeasy® mericom Food (DMF), no reportado previamente su uso para su aplicación en insectos, que resultó en ADN suficiente y de alta calidad para reacciones de amplificación por PCR. El método permitió procesar un solo insecto por extracción, y obtener material genético de muestras conservadas en alcohol de hasta ocho años de antigüedad. El límite de detección se definió hasta una concentración de 780 pg/ul. Se optimizóla PCR en un volumen final de 15 uL sin comprometer calidad de la amplificación. La técnica estandarizada permitió la obtención de ADN de calidad, lo que aseguró alta reproducibilidad y sensibilidad en la detección de especies de Xyleborus y la secuenciación parcial del gen CO1 para las siete especies estudiadas; las secuencias consenso fueron analizadas por homología y depositadas en el GenBank.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Biografía del autor/a

María Elena Sosa-Castillo, Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo

Fitosanidad, Entomología y Acarología

Laura Delia Ortega Arenas, Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo

Fitosanidad, Entomología y Acarología

Alfonsina Judith Hernández, Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo

Fitopatología

Citas

Atkinson T. H., Carrillo, D., Duncan, R. E. & Peña, J. E. 2013. Occurrence of Xyleborus bispinatus (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) Eichhoff in southern Florida. Zootaxa, 3669, 96-100. DOI: https://doi.org/10.11646/zootaxa.3669.1.10

Barrio-Caballero, P. A. 2012. Revisión de métodos de extracción de ADN a partir de restos óseos en el laboratorio forense. Revista Española Médico Legal, 39, 54-62. DOI: https://doi.org/10.1016/j.reml.2012.11.002

Bolívar A. M., Rojas, A. & García-Lugo, P. 2014. PCR y PCR-Múltiple: parámetros y protocolos de estandarización. Avances en Biomedicina, 3, 25-33.

Chang H., Liu, Q., Hao, D., Liu, Y., An, Y., Qian, L. & Yang, X. 2013, DNA barcodes and molecular diagnostics for distinguishing introduced Xyleborus (Coleoptera: Scolytinae) species in China. Mitochondrial ADN. Early Online, 1-7. DOI: https://doi.org/10.3109/19401736.2013.779260

Cognato A. I., Hulcr, J., Dole, S. A. & Jordal, B. H. 2011,

Phylogeny of haplo-diploid, fungus-growing ambrosia beetles (Curculionidae: Scolytinae: Xyleborini) inferred from

molecular and morphological data. Zoologica Scripta, 40, 174-186.

Cognato, A. I. & Sperling, F. A. 2000. Phylogeny of Ips DeGeer species (Coleoptera: Scolytidae) inferred from mitocondrial cytochrome oxidase I DNA sequence. Molecular Phylogenetic Evolution, 14, 445-460. DOI: https://doi.org/10.1006/mpev.1999.0705

Cornejo, R. A., Serrato D., A., Rendón A., B. & Rocha M., M. G. 2014. Herramientas moleculares aplicadas en ecología: aspectos teóricos y prácticos. Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales (SEMARNAT). Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático (INECC), Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa (UAM-I), 255 pp.

Dole, S. A., Jordal, B. H. & Cognato, A. I. 2010. Polyphyly of Xylosandrus Reitter inferred from nuclear and mitochondrial genes (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 54, 773-782. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2009.11.011

FAO-IPPC 2007. NIMF N° 2. Marco para el análisis de riesgo de plagas. Normas Internacionales para Medidas Fitosanitarias. Secretaría de la Convención Internacional de Protección Fitosanitaria. Disponible en:http://www.cosave. org/sites/ default/files/nimfs/ cfd338f5bbd3cf63500f 97fbca 940633.pdf (Consulta: Mayo 2015).

Harrington T. C., Aghayeva, D. N. & Fraedrich, S. W. 2010. New combinations is Raffaelea, Ambrosiella and Hyalorhinicladiella, and four new species from the redbay ambrosia beetle, Xyleborus glabratus. Mycotaxon, 111, 337-361. DOI: https://doi.org/10.5248/111.337

Hernández, G., A. K. & Guzmán B., M. M. 2014. Detección del virus del amarillamiento de los nervaduras de la hoja de la papa en diferentes órganos de Solanum tuberosum grupo Phureja cv Criolla Colombia utilizando RT-PCR convencional y en tiempo real. Revista Colombiana de Biotecnología, 16, 74-85. DOI: https://doi.org/10.15446/rev.colomb.biote.v16n1.44226

Jiménez A., Cortez, S., Duarte, L. Z., Martínez, M., Flórez, S. Y., Méndez, C., Granados, M. & Villamizar, A. 2014. Estandarización de una PCR anidada para la identificación de Lawsonia intracellularis en porcinos. Spei Domus, 10, 23-29. DOI: https://doi.org/10.16925/sp.v10i20.887

Kuerová Z., Li, Z. & Hromádková, J. 2009. Morphology of nymphs of common stored-product psocids (Psocoptera: Liposcelididae). Journal Stored Products Research, 45, 54-60. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jspr.2008.08.002

Kušec I. D., Radišic, Ž., Komlenic, M. & Kušec, G. 2015. Comparison of commercial DNA Kits and traditional DNA extraction procedure in PCR detection of pork in dry/fermented sausages. ISSN 1330-7142. UDK: 637.52:636.082. Disponible en: http://bib.irb.hr/ datoteka/779345.47_Djurkin_Kusec _ENGEDIT _20_07_

pdf (Consulta: Noviembre 2015).

Loera, F. 2014. The family Lauraceae in Mexico. In: Memoria del Simposio Internacional sobre Manejo y Control de Plagas Cuarentenarias (Caso: Escarabajos ambrosiales, Xyleborus glabratus y Euwallacea sp.) en el aguacatero. 3 al 7 de noviembre 2014. Xalapa, Veracruz, México. 62 pp.

Martínez-de la Puente J., Ruiz, S., Soriguer, R. & Figueroa, J. 2013. Effect of blood meal digestion and DNA extraction protocol on the success of blood meal source determination in the malaria vector Anopheles atroparvus. Malaria Journal, 12, 109. DOI: https://doi.org/10.1186/1475-2875-12-109

Marzachi, C., Veratti, F. & Bosco, D. 1998. Direct PCR detection of phytoplasms in experimentally infected insects. Annals of Applied Biology, 133, 45-54. doi: 10.1111/j.1744-7348.1998.tb05801.x DOI: https://doi.org/10.1111/j.1744-7348.1998.tb05801.x

Pérez, S. M., Equihua M., A. & Atkinson, T. H. 2015a. Identificación de las especies mexicanas del género Xyleborus Eichhoff, 1864 (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae). Insecta Mundi, 0440, 1-35.

Pérez, S. M., Equihua M., A., Estrada V., E., Muñoz V., A.L., Valdez C., J.M., Sánchez E., J. & Atkinson, T. H. 2015b. Sinopsis de especies mexicanas del género Xyleborus Eichhoff, 1864 (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae). Acta Zoológica Mexicana (n.s.), 31, 239-250. DOI: https://doi.org/10.21829/azm.2015.312546

Pérez-De La Cruz, M., Equihua M., A., Romero-Nápoles, J., Valdez-Carrasco, J. M. & De La Cruz-Pérez, A. 2009. Claves

para la identificación de escolítinos (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) asociados al agro-ecosistema del cacao en el sur de México. Boletín del Museo de Entomología de la Universidad del Valle, 10, 14-29.

Promega 2015. Certificate of analysis GoTaq ADN polimerasa (M3005). Disponible en: https:// worldwide.promega.com/~/media/files/resources/protocols/product%20information%20sheets/g/gotaq%20ADN%20polymerase%20m300.pdf (Consulta: Agosto 2015).

Qiagen 2010. DNeasy® mericon TM Food Handbook for extraction of total nucleic acids from a range of food simple types. Disponible en: https://www.qiagen.com/hk/ resources/resourcedetail?id=d0e372d7-6f6a-415e-9d72-297a53d95854&lang=en (Consulta: 2015).

Rabaglia R. J., Dole, S. A. & Cognato, A. I. 2006. Review of American Xyleborina (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae ) occurring north of Mexico, with an illustrated key. Annals of the Entomological Society of America, 99, 1034-1056. DOI: https://doi.org/10.1603/0013-8746(2006)99[1034:ROAXCC]2.0.CO;2

Reineke A., Karlovsky, P. & Zebitz C., P. W. 1998. Preparation and purification of ADN from insects for AFLP analysis. Insect Molecular Biology, 7, 95-99. doi: 10.1046/j.1365-2583.1998.71048.x. DOI: https://doi.org/10.1046/j.1365-2583.1998.71048.x

Schwerer M. J., Vogl, S. & Graw, M. 2015. Extraction of ADN from gastric content in different stages of digestion. Forense Science International: Genetics Supplement Series. Disponible en: http://dx.doi.org /10.1016/ j.fsigss.2015.10.004 (Consulta: Noviembre 2015).

SENASICA. 2015. Escarabajo ambrosial del Laurel Rojo Xyleborus glabratus, Eichhoff (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae). Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria. Secretaría de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación. México. 11 pp.

Suzuki, S. & Yao, I. 2014 Isolation of nine polymorphic microsatellite loci from the burying beetle, Nicrophorus quadripunctatus (Coleoptera: Silphidae). Applied Entomology, 49, 493-497. DOI: https://doi.org/10.1007/s13355-014-0269-8

Tamura K., Stecher, G., Peterson, D. & Kumar, S. 2013. Mega 6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Phylogenetics and Evolution, 30, 2725-2729. DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/mst197

Villarreal, J., Soto, Z., Pereira, N., Varela, L., Jaramillo, R., Villanueva, D. & Mendoza, E. 2008. Reacción en cadena de la polimerasa para la detección de Salmonella sp. en leche en polvo. Optimización del método en 12 horas. Salud Uninorte, 2, 216-225.

Volk H., Piskernik, S., Kurincic, M., Klancnik, A. & Jeršek, B.

Evaluation of different methods for DNA extraction from milk. Journal of Food and Nutrition Research, (2), 1-10.

Wood, S. L. 1986. A reclassification of the genera of Scolytidae (Coleoptera). Great Basin Naturalis Memoirs, 10, 126.

Descargas

Publicado

23-05-2017

Cómo citar

Sosa-Castillo, M. E., Lara Reyna, J., Ortega Arenas, L. D., & Judith Hernández, A. (2017). Estandarización y validación de la prueba de pcr anidada para el diagnóstico de especies del género xyleborus (coleoptera: curculionidae: scolytinae). ACTA ZOOLÓGICA MEXICANA (N.S.), 33(1), 18–26. https://doi.org/10.21829/azm.2017.3311008
Metrics
Vistas/Descargas
  • Resumen
    446
  • PDF
    440
  • HTML
    635

Número

Sección

Artículos originales

Métrica

Artículos similares

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 > >> 

También puede Iniciar una búsqueda de similitud avanzada para este artículo.